注冊日本公司需要相關手續，同理，日本公司不要了也不能置之不理，需要辦理注銷手續，如果不注銷每年還是要進行年審和報稅。日本公司注銷并不復雜，理清相關手續步驟即可。首先選擇日本公司注銷的方式：
1、注銷
公司注銷是指當一個公司宣告破產時，被其它的公司進行收購、規定的營業期限屆滿不續、或者公司內部解散等情形時，公司需要到登記機關申請注銷，終止公司法人資格的一個過程。
公司注銷可以是主動行為比如說執照期滿不續，也可以是被動行為，例如公司被撤銷或被吊銷之后都應該按照法律規定進行清算并進行注銷。
2、吊銷
吊銷是指企業違反了工商行政管理的相關法規，被工商部門采取強制手段剝奪其經營資格的一種行政處罰。這是行政機關對企業實施的較為嚴厲的行政處罰。吊銷屬于一種行政處罰，不會以企業申請為前提，主要是由登記機關直接依職權、主動而為。吊銷后公司經營資格也將會喪失，從某一定程度上來講，吊銷也是公司退出市場的一種方式，但和注銷相比，吊銷不是一種合法的退出市場的方式，而是因為違法行為導致的一種行政處罰。
3、撤銷
撤銷是指工商部門或者是其上級行政機關根據利害關系人的請求或者依據職權，作出的撤銷行政行為的一種決定。
通俗上來講，撤銷就是對已經完成的登記行為的否定，或者說是一種糾錯的行為，錯誤的登記喪失法律效力。前提是自始不符合登記的相關條件，但是通過非法情形取得了公司的登記，比如登記人員濫用職權、違反法定的程序，或者申請人提交虛假材料、隱瞞了一些重要的事實等等，登記機關通過撤銷來糾正這個登記錯誤。
常見的三種撤銷包括了：
（1）撤銷公司設立登記，后果是公司設立登記自始無效；
（2）撤銷公司變更登記，后果是公司恢復到該次變更登記之前的登記狀態；
（3）撤銷公司注銷登記，后果是公司恢復到注銷之前的登記狀態。
我們常說的日本公司注銷說的就是第一種方式。日本分支機構和日本分公司注銷的手續不一樣，我們一起來看看。
日本分支機構注銷手續
在日本注銷分支機構，要辦理分支機構的注銷登記和所有代表人的卸任手續。如果不辦理所有駐日代表人的卸任手續，就不能注銷日本分支機構的注冊證照。這是因為如果代表人的注冊證照仍然存在，就有可能繼續經營業務。相反，如果駐日的所有代表人都成功辦理卸任手續，在日本的分支機構也同被注銷。所有在日代表人的卸任手續的一般流程如下：
1、外國企業決定注銷分支機構，撤銷駐日的所有代表人；
2、通過個別通知和政府公報催告債權人對注銷分支機構提出異議；
3、向稅務機關申報備案納稅管理人；
4、關閉分支機構(上述2的通知和公告發布1個月以后）；
5、制作注銷分支機構，撤銷駐日所有代表人相關的宣誓陳述書；
6、由駐日大使館領事等認證宣誓陳述書；
7、向法務局申請撤銷駐日所有代表人；
8、領取注銷事項證明(申請注銷后約2周)；
9、向稅務機關等申報分支機構的注銷；
在對所有駐日代表人辦理卸任手續后，注冊證照會被注銷，但不會記錄分支機構的注銷日期。通常，只需在宣誓陳述書中記錄分支機構的注銷日期。如需在注冊證照上記錄分支機構的注銷日期，必須辦理（1）分支機構的注銷手續，（2）所有駐日代表人的卸任流程兩種手續。另外，如管轄駐日代表人的住址所在地和分支機構所在地的法務局不同，則有可能要向管轄代表人住址所在地的法務局申請同營業所地址變更相同的手續。
日本子公司注銷手續
解散、清算子公司(日本法人)手續的一般流程(股份公司，聯營公司)：
1、股東大會等通過決議解散子公司（日本法人）并委任清算人；
2、向法務局申請注冊子公司（日本法人）的解散和清算人的委任；
3、向稅務機關申報子公司(日本法人)的解散和清算人的委；
4、通過個別通知和政府公報催告債權人對子公司(日本法人)的清算主張債權；
5、制定解散時的資產負債表以及資產目錄；
6、股東大會決議通過上述資產負債表以及資產目錄（聯營公司的情況下，需通知各雇員）；
7、確定并分配剩余資產；
8、股東大會等決議通過清算終結 (上述4的通知和公告發布2個月以后）；
9、向法務局申請注冊子公司（日本法人）的清算終結；
10、領取注銷事項證明（申請注銷后約2周）；
11、向稅務機關等申報子公司（日本法人）的清算終結。
日本公司注銷需要提供的資料
1、公司法定代表人簽署的《公司注銷登記申請書》以及公司清算組織負責人簽署的注銷登記申請書；
2、《企業法人營業執照》正、副本、稅務部門出具的完稅證明；
3、股東會或者有關機關確認的清算報告、法院破產裁定、行政機關責令關閉的文件或公司依照《公司法》作出的決議或者決定；
4、銀行出具的帳戶注銷證明以及法律、行政法規規定應當提交的其他文件。
需要注意的是，即使日本公司以及申請破產了，依然需要走公司注銷手續，因為雖不需要辦理注銷手續，工商營業執照不再年檢將會自動注銷公司執照，但是這樣的做法在3年內不再有資格成為公司法人，3年后才可以恢復正常，所以對于這點還是建議大家辦理正規的注銷手續。
綜上所述，注銷日本公司雖然不難，但是需要的資料文件并不少，當然如果自己一個人相關部門申請那就是一頭霧水的，專業事情還是要請專業的人來辦理好，既能省事又能避免各種潛在的風險。
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